1、用途不同。虽然二者都是用于国家建设，参与政府资金周转的，专项债券具有固定的投资方向和投资项目，不能随意用于其他地方，但一般债券的范围更广，投资更多元化。

2、承担风险不同。虽然二者都是政府债券，由政府背书，但是从收益的安全性看，地方债一般债的偿还来源是财政收入，安全性要高于专项债债券。

3、偿还途径不同。专项债券的偿还途径地方是项目建成后取得的收入作为保证;一般债券的偿还途径一般是地方政府以本地区的财政收入作为担保。