在民事案件中，如果当事人对管辖权有异议，那么应该在案件审判期间，进行异议提出，法院会对当事人提出的异议立即审查。如果异议成立，那么有关审查部门会将案件移送给有管辖权的人民法院。如果异议不成立，那么裁定部门就会将异议驳回。如果认为此法院不可以行使管辖权，那么可以申请向上一级人民法院进行裁决。

法律依据：

《人民法院办理刑事案件庭前会议规程(试行)》第十一条：被告人及其辩护人对案件管辖提出异议，应当说明理由。人民法院经审查认为异议成立的，应当依法将案件退回人民检察院或者移送有管辖权的人民法院；认为本院不宜行使管辖权的，可以请求上一级人民法院处理。人民法院经审查认为异议不成立的，应当依法驳回异议。