1、外形区别：荔枝和红毛丹外壳大多虽都为红色，但是荔枝果皮表面有鳞斑状的突起手感粗糙，而红毛丹外壳有长软刺，状似刺球。另外成熟荔枝主要有鲜红色和紫红色两种，而成熟红毛丹则有黄色果子。

2、内容区别：荔枝和红毛丹的果肉很相似，但是果核却大不相同。两者的核一般都不直接食用，荔枝核功效良多通常做药材，而红毛丹的核则因为脂肪含量高常用于制作肥皂。

3、营养区别：荔枝含有丰富的维生素，对于微细血管的血液循环有促进作用，能防止产生雀斑让肌肤更光滑，而且荔枝糖分较高能补充能量缓解疲劳症状。红毛丹则是含有大量的铁元素，能帮助改善头晕、低血压等情况，此外红毛丹还具有健发美肤的功效。

4、食用区别：荔枝食用处理起来比较方便，直接剥掉果壳就可食用，红毛丹果壳比荔枝壳厚，直接剥会伤害手指甲，需要两手像开瓶盖一样旋开。另外红毛丹的核上有一层脆而坚硬的膜于果肉相连，这层膜肠胃无法消化吃进去还可能划破肠胃内壁，因此红毛丹在食用时要用牙一层一层慢慢的咬以免吃到这层膜。