1、系统在扣款时，会优先划扣主贷人的还款银行卡。

2、按照公积金贷款的顺序来看，夫妻共同申请公积金贷款，其中一个为主贷人另一个为次贷人，不存在同时扣两个人公积金款项的意思。

3、不过是可以用夫妻两个人的公积金来还款的，还款时是可以用两个人的。只要有合法的房屋合同，房屋的所有权是两个人的，公积金完全是可以用来支付买房的。多数情况下，只有划扣主贷人的还款银行卡，金额不足以还清本期月供时，系统才会划扣次贷人的还款银行卡。