淡水珍珠与海水珍珠(以南珠为例)的养殖技术是不同的，因此结构也有所不同。淡水珍珠是无核的，所有的成分都由珍珠质组成，因此若以淡水珍珠制成珍珠粉，不存在其它物质混杂。而海水珍珠是有核的，其核一般由猪蹄蚌的贝壳磨成，珍珠质仅覆盖于表面，厚0.1~0.3毫米，生长期3-5年左右(淡水珠达4~5年)。但如果海水珍珠要加工成100%的珍珠粉，必须先去掉内核，成本很高，也不易加工。