经侦科所管辖的案件种类有很多，因此立案金额应当根据不同的案件而定。如果是信用卡诈骗案的，诈骗数额在五千元以上的，公安机关应当立案。如果是属于票据诈骗案的，个人进行金融票据诈骗，数额在一万元以上的，公安机关应当立案。

法律依据：

《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》五十一条

进行金融票据诈骗活动，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉:

(一)个人进行金融票据诈骗，数额在一万元以上的；

(二)单位进行金融票据诈骗，数额在十万元以上的。