赛尔号启航不同登录方式不互通。赛尔号启航是手游，而赛尔号互通版是网页游戏，二者是不互通的。《赛尔号：启航》是2017年由上海淘米网络科技有限公司出品开发的回合制战术养成类游戏，原同名页游复刻版。游戏定为APP手游，但是仍可在网页（电脑、手机）上游玩，数据与原页游《赛尔号》不互通。

赛尔是玩家在游戏中扮演的角色，玩家在除精灵对战外只能操控赛尔。赛尔主要指挥精灵参加战斗，自己并不参加。一个玩家只能操控一个赛尔，由玩家控制的赛尔可以在游戏中任意变更名称与皮肤颜色。