1、所属的单位不同，中国证券业协会属于非营利性社会团体，中国证监会则是国务院直属正部级事业单位，属于国家的职能部门，按照法律、法规和国务院授权，统一监督管理全国证券期货市场。

2、人员配置不同，中国证券业协会人员不固定，会员不领工资，必须接受中国证监会和国家民政部的业务指导与监督管理；中国证监会设在北京，机关内设有21个职能部门，1个稽查总队和3个中心。

3、职责不同，中国证券业协会的主要职责包括教育和组织会员遵守证券法律、行政法规，依法维护会员的合法权益，制定会员应遵守的规则，组织会员单位的从业人员的业务培训，开展会员间的业务交流等等；中国证监会的职责是研究和拟订证券期货市场的方针政策、发展规划；起草证券期货市场的有关法律、法规，提出制定和修改的建议；制定有关证券期货市场监管的规章、规则和办法等等。

4、中国证券业协会是自律组织，服务机构，而证监会是监督机构，中国证券业协会主要负责行业内消息、咨询、业务的研究和交流，中国证监会统一监督管理全国证券期货市场，维护证券期货的市场秩序，保障其合法运行，员工是国家公务员。