1、风险不同：债券基金和货币基金的一大不同在于风险等级，与货币基金相比，债券基金的风险更大一些，债券基金短期会有价格波动，不保证本金收益，一般长期稳定增长；而货币基金更安全，具有保本的的优势。

2、收益机会有差异：既然债券基金的风险更大，那么其获得收益会更大；其收益水平要普遍高于货币基金的收益水平。当然不同债券基金的收益水平也不同。

3、流动性差异：货币基金还具有高流动性的特征，虽然二者都可以随时申赎，但是货币基金的到账速度更快，一般T+1即可，有的货币基金如余额宝等，可以随转随用更加方便。而债券基金一般受基金公司的结算速度影响，一般至少要两三天。

4、投资方向不同：货币基金投资于流动性较强，安全性较高的现金存款等；债券基金一般可以投资固定收益类，且有机会利用较小比列的高收益标的获得增值。

5、计息方式不同：货币基金以预计7日年化收益率为参考，按万份收益计算；债券基金按照基金净值计算收益，二者都不保收益。