1、介质不一样：纸质发票是以纸张的形式呈现的，而电子发票多以数字化方式呈现。

2、使用时间不一样：纸质发票的诞生早于电子发票，电子发票是在2012年年初在北京、浙江、广州、深圳等22个省市开展网络（电子）发票应用试点的。

3、保存方式不一样：纸质发票需要保存好纸质发票，电子发票只需保存电子档，必要的时候再打印，可以避免因丢失纸质发票带来的诸多不便。

4、成本不一样：与传统纸质发票相比，电子发票管理系统可以在线开票，节省发票工本费、税控机成本以及相关人力成本。

5、操作方式不一样：与传统发票相比，电子发票无需通过“税控机”，也不需要企业负责人频频到税务部门登记注册。而且它能瞬间即成，虚假真伪即刻核实，操作简便易行。