福州市高新区属于福州滨海地区，实行“一区多园”的管理模式，下辖海西高新技术产业园、生物医药和机电产业园以及洪山、仓山、马尾和福州软件园等6个园区。

福州高新区主体园区位于福州中心城的西南侧，与福州主城区仅一江之隔，交通条件十分便捷与空港、码头构成“一小时交通圈”。海西园定位以高端研发、科技孵化和总部经济为主体，规划面积12.35平方公里；“两园”定位为高新技术辐射区域，以生物医药和机电、光电等生产性项目为主，规划面积12.87平方公里。