1、缴纳群体不同：国管公积金是中央国家机关及在京单位的职工缴纳的公积金；而市管公积金是指地方省市单位、城镇企业、事业单位职工缴纳的公积金。

2、贷款办理时间不同：国管公积金贷款的办理时间通常为45-60天；市管公积金贷款办理时间通常是30-45天。

3、还款方式：国管公积金还款方式有限，只能等额本息或等额本金；而市管公积金贷款还款方式可以任意选择。

4、使用范围不同：国管公积金可以跨地区使用；而市管公积金只能在缴纳地区使用。