1、种类不同：金枪鱼属于海水鱼；三文鱼属于溯河洄游性鱼类。在营养价值上，三文鱼则是稍稍欠佳一些。

2、产区不同：金枪鱼分布在印度洋、中太平洋和中大西洋；三文鱼主要分布在北太平洋、欧洲、亚洲和北美。

3、口感不同：金枪鱼是一种深海鱼类，特点是肉质鲜嫩可口，蛋白质含量高，脂肪含量低，俗称“海底鸡”。三文鱼味甜，性质温和，属胃经。具有滋补、健脾养胃、温胃等功效，适合消瘦、水肿、消化不良。