1、针对的对象不同。银行协议存款的针对的对象是具有特殊性质的资金，如保险资金、社保资金或养老保险基金等等。银行协定存款针对的对象不固定，只要符合投资金额的相关存款要求的任何投资者都可以投资。

2、存款的期限不同。银行协议存款对象比较特殊，存款期限通常较长，一般情况下都是好几年。而协定存款的存款期限一般比较短，最长是一年。

3、利率不一样。协定存款的利率是由投资方和银行双方商量好的，而协议存款的利率是由两部分购成，一个部分是固定的存款利率，一部分是活期利率。

4、两种存款的功能不同。协议存款的资金可以提前支取，而且还可以协议存款的凭证可以用作抵押物进行融资。协定存款只是一种存款，不能进行融资。