1、鉴证作用：审计事实确认书对被审计单位会计报表中所反映的财务状况、经营成果和现金流量情况的合法、公允一贯具有鉴证作用。

2、保护作用：审计事实确认书在一定程度上对被审计单位的财产、债权人和股东的权益，及企业利害关系人的利益起到保护作用。

3、证明作用：审计事实确认书，可以证明注册会计师在审计过程中是否完成预定的审计程序、是否以审计工作底稿为依据客观地表示审计意见；表示的审计意见是否与被审计单位的实际情况相一致；审计工作的质量是否符合一定的要求。通过审计事实确认书，可以证明注册会计师审计责任的履行情况。