性质不同：太原站是火车站，太原南站是高铁站。

位置不同：太原南站位于太原市小店区北营北路；太原站位于太原市迎泽区建设南路2号。

太原站，隶属太原铁路局管辖，现为特等站。太原枢纽联接南北同蒲线、石太线、石太客专、太焦线、太中银线、京原线、介西线等。2008年进行大规模改造，将太原站运输能力提升将近一倍。太原站每日有70对列车发往全国大部分省市。目前和太原南站共同成为承担太原市乃至山西省客流吞吐，中转的主要力量。

太原南站是山西最大型的综合性交通枢纽，毗邻百年名校山西大学、太原市高新技术开发区以及财经类高等学府山西财经大学，是一个集高速铁路、普通铁路，以及公交、出租、轨道交通等市政交通设施为一体的区域性综合立体交通枢纽，总投资近100亿元，主要办理南同蒲、北同蒲、太焦线、石太线、石太客运专线和太中银铁路以及太原西南环线、大西客专客运专线旅客列车的始发、终到及停站通过作业。