1、一般公司需要申报纳税的税种主要包括个人所得税、增值税、附加税、印花税、企业所得税以及财务报表。一般纳税人每月申报个人所得税、增值税、附加税与印花税；每季度申报企业所得税与财务报表。小规模纳税人除了个人所得税与印花税，其他税种每季度申报与缴税。次年各公司需要完成上一年度汇算清缴。

2、个人所得税：公司申报与缴纳个税需要登录“自然人电子税务局（扣缴端）”。公司先在系统中维护人员信息，接下来填写综合所得申报表，系统计算个人所得税，公司复核无误后提交申报并缴纳税款。

3、增值税与附加税：公司申报增值税与附加税需登录“电子税务局申报客户端”。申报增值税之前，需先完成两项工作，一项是进项税的网上认证，另一项是开票软件数据的上报汇总。完成上述两项工作，才能正确采集进项税与销项税信息。采集好进项税与销项税信息，相应的增值税申报表可自动取数，这里需要提示一点，如果公司存在未开票收入，需要手工在销项采集中录入，不可遗漏。公司复核每张增值税申报表，包括附加税申报表，复核无误后提交申报并缴纳税款。

4、印花税：如果公司有需要缴纳的印花税，需要登录电子税务局网页，在印花税申报界面如实填写申报表并提交，最后缴纳税款。

5、企业所得税：公司申报企业所得税可以登录“电子税务局申报客户端”，也可以在电子税务局网页上的相关界面完成。公司需根据财务数据如实填写企业所得税申报表，审核无误后提交申报，如有需要，预缴企业所得税。

6、财务报表：除了上述纳税申报之外，公司每季度需申报财务报表，包括资产负债表、利润表以及现金流量表。公司按照财务数据如实填表并申报。财务报表申报与纳税申报一样，是有申报期限的，公司不能遗漏。

7、汇算清缴：公司在次年的申报期限内要完成上一年度汇算清缴工作。公司根据税法的相关规定，填列与申报纳税调整等，最终根据汇算清缴的结果，对上一年度企业所得税的预缴税款多退少补。